York University Phenology Project - ITS2, library #2, >0.99 barcode matches

Occurrence
Versão mais recente published by Test Organization #1 on out 9, 2024 Test Organization #1
Publication date:
9 de outubro de 2024
Published by:
Test Organization #1
Licença:

Baixe a última versão do recurso de dados, como um Darwin Core Archive (DwC-A) ou recurso de metadados, como EML ou RTF:

Dados como um arquivo DwC-A download 2.421 registros em English (164 KB) - Frequência de atualização: diariamente
Metadados como um arquivo EML download em English (6 KB)
Metadados como um arquivo RTF download em English (6 KB)

Descrição

The York University Phenology Project evaluated the utility of managed honey bee (Apis mellifera) colonies as bio-monitors of plant community phenology. Using Amro Zayed's urban apiary as the study site, pollen traps were installed at the base of 5 honey bee colonies, and pollen was collected weekly during a 24 hr. sampling period for 15 weeks. On-site field monitoring of plants in flowering was simultaneously completed using a 1000 m. radius around the study site. Collected pollen samples were split into two libraries, each of which underwent two-locus metabarcoding using ITS2 and rbcL1, yielding 4 total metabarcoding libraries. This metabarcoding library contains ITS2 ASVs for weeks 5 – 15 that were matched to a MetaCurator reference barcode with a >0.99 similarity threshold. Metabarcoding methods were independently validated and are described here: https://link.springer.com/article/10.1186/s13007-023-01097-9 The study site was urban, featuring many ornamental plantings of non-native species, and mixed-wood lots of native and invasive species.

[This dataset was processed using the GBIF Metabarcoding Data Toolkit.]

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 2.421 registros.

Também existem 1 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.

Occurrence (core)
2421
dnaDerivedData 
2421

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Test Organization #1. This work is licensed under a https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/.

GBIF Registration

Este recurso não foi registrado pelo GBIF

Palavras-chave

Occurrence

Contatos

Sydney Wizenberg
  • Provedor Dos Metadados
  • Originador
  • Ponto De Contato
  • Postdoctoral Fellow
Naturalis Biodiversity Center
Leiden
NL
Amro Zayed
  • Originador
  • Professor
York University
Toronto
Ontario
CA
Mateus Pepinelli
  • Originador
  • Professor
Laurentian University
Sudbury
Ontario
CA
Ida Conflitti
  • Originador
  • Project Manager
York University
Toronto
Ontario
CA

Metadados Adicionais

Identificadores alternativos https://ipt.gbif-uat.org/resource?r=mdt-upload