York University Phenology Project - ITS2, library #2, >0.99 barcode matches

Registro biológico
Última versión publicado por Test Organization #1 el oct. 9, 2024 Test Organization #1
Fecha de publicación:
9 de octubre de 2024
Publicado por:
Test Organization #1
Licencia:

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Datos como un archivo DwC-A descargar 2.421 registros en Inglés (164 KB) - Frecuencia de actualización: diario
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Descripción

The York University Phenology Project evaluated the utility of managed honey bee (Apis mellifera) colonies as bio-monitors of plant community phenology. Using Amro Zayed's urban apiary as the study site, pollen traps were installed at the base of 5 honey bee colonies, and pollen was collected weekly during a 24 hr. sampling period for 15 weeks. On-site field monitoring of plants in flowering was simultaneously completed using a 1000 m. radius around the study site. Collected pollen samples were split into two libraries, each of which underwent two-locus metabarcoding using ITS2 and rbcL1, yielding 4 total metabarcoding libraries. This metabarcoding library contains ITS2 ASVs for weeks 5 – 15 that were matched to a MetaCurator reference barcode with a >0.99 similarity threshold. Metabarcoding methods were independently validated and are described here: https://link.springer.com/article/10.1186/s13007-023-01097-9 The study site was urban, featuring many ornamental plantings of non-native species, and mixed-wood lots of native and invasive species.

[This dataset was processed using the GBIF Metabarcoding Data Toolkit.]

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 2.421 registros.

también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

Occurrence (core)
2421
dnaDerivedData 
2421

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Test Organization #1. This work is licensed under a https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/.

Registro GBIF

Este recurso no ha sido registrado en GBIF

Palabras clave

Occurrence

Contactos

Sydney Wizenberg
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Originador
  • Punto De Contacto
  • Postdoctoral Fellow
Naturalis Biodiversity Center
Leiden
NL
Amro Zayed
  • Originador
  • Professor
York University
Toronto
Ontario
CA
Mateus Pepinelli
  • Originador
  • Professor
Laurentian University
Sudbury
Ontario
CA
Ida Conflitti
  • Originador
  • Project Manager
York University
Toronto
Ontario
CA

Metadatos adicionales

Identificadores alternativos https://ipt.gbif-uat.org/resource?r=mdt-upload