York University Phenology Project - ITS2, library #2, >0.99 barcode matches

Occurrence
Dernière version Publié par Test Organization #1 le oct. 9, 2024 Test Organization #1
Date de publication:
9 octobre 2024
Publié par:
Test Organization #1
Licence:

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Description

The York University Phenology Project evaluated the utility of managed honey bee (Apis mellifera) colonies as bio-monitors of plant community phenology. Using Amro Zayed's urban apiary as the study site, pollen traps were installed at the base of 5 honey bee colonies, and pollen was collected weekly during a 24 hr. sampling period for 15 weeks. On-site field monitoring of plants in flowering was simultaneously completed using a 1000 m. radius around the study site. Collected pollen samples were split into two libraries, each of which underwent two-locus metabarcoding using ITS2 and rbcL1, yielding 4 total metabarcoding libraries. This metabarcoding library contains ITS2 ASVs for weeks 5 – 15 that were matched to a MetaCurator reference barcode with a >0.99 similarity threshold. Metabarcoding methods were independently validated and are described here: https://link.springer.com/article/10.1186/s13007-023-01097-9 The study site was urban, featuring many ornamental plantings of non-native species, and mixed-wood lots of native and invasive species.

[This dataset was processed using the GBIF Metabarcoding Data Toolkit.]

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 2 421 enregistrements.

1 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Occurrence (noyau)
2421
dnaDerivedData 
2421

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Test Organization #1. This work is licensed under a https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/.

Enregistrement GBIF

Cette ressource n'a pas été enregistrée sur le portail GBIF

Mots-clé

Occurrence

Contacts

Sydney Wizenberg
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Créateur
  • Personne De Contact
  • Postdoctoral Fellow
Naturalis Biodiversity Center
Leiden
NL
Amro Zayed
  • Créateur
  • Professor
York University
Toronto
Ontario
CA
Mateus Pepinelli
  • Créateur
  • Professor
Laurentian University
Sudbury
Ontario
CA
Ida Conflitti
  • Créateur
  • Project Manager
York University
Toronto
Ontario
CA

Métadonnées additionnelles