選單:資源管理
此選單僅對具有管理權限的使用者可見。
此頁面允許具有相應角色(經理和管理員)的使用者對現有資源進行更改或創建新資源。
資源管理表格
當首次打開「資源管理」頁面時,將顯示當前使用者有權更改的現有資源表格,包括該使用者創建的資源以及其他人邀請其管理的資源。關於「名稱」、「組織」、「類型」、「子類型」、「紀錄數量」、「最後修改時間」、「上次發布時間」和「下次發布時間」等欄位的詳細說明,請參閱 公共資源表格。此外,「資源管理表格」還包含以下資源基本資訊欄位:
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可見性 - 指定誰有權查看資源的類別。如果資源為「公開」,則所有使用者都能在首頁的 公共資源表格中查看。如果資源為「私密」,則僅創建者、被邀請管理該資源的使用者以及具有管理員角色的使用者才能在「資源管理表格」中看到。關於邀請他人管理資源的詳細資訊,請參閱「資源管理」中「資源概覽」標題下「資源管理員」的部分。
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作者 - 創建該資源的 IPT 使用者。
創建新資源
在「資源管理表格」下方有一個表單,可用於創建新資源。首先,需要為資源提供一個唯一的「短名稱」。該短名稱將用於在 IPT 實例中唯一標識該資源,並用於生成訪問資源的 URL。短名稱必須至少包含三個字元,可包含字母和數字(A-Z、a-z 和 0-9),但不得包含空白、破折號和底線以外的標點符號,或重音字元(例如,「firstresource」或「first_resource」,但不能是「first resource」或「première ressource!」)。其次,需要提供一個資源類型。請注意,當加載一個可選的 Darwin Core 存檔資源時(詳見下文),系統將自動確定並覆蓋此選擇的類型。第三,可以上傳可選的存檔資源。以下部分將描述可以衍生新資源的不同類型的存檔資源:
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上傳達爾文核心集檔案 或是 Camtrap 無摩擦資料包,
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[上傳一個詮釋資料檔案](EML 或無摩擦詮釋資料)
當然,您也可以選擇 完全創建一個新的資源,而不加載現有的存檔資源。在此選項中,資源的配置將需要通過 IPT 表單全部創建,包括上傳資料來源檔案(或連接到資料庫或 URLs)並將其中的欄位對照到適當延伸資料集中的術語。請注意,IPT 有 10GB 的檔案上傳限制,但是,IPT 匯出/發布的達爾文核心集檔案大小沒有限制。請參閱 有關檔案上傳限制的說明 以了解如何應對檔案上傳限制。
開始時,請先輸入新的資源簡稱,然後按下標有「創建」的按鈕。這將打開資源概覽頁面。接著,根據「選單:資源管理」部分中「資源概覽」標題下的說明,完成資源管理頁面的各個部分。
上傳達爾文核心集檔案
IPT 可以匯入大小高達 10GB 的達爾文核心集檔案。關於達爾文核心集檔案的資訊可以在 Darwin Core 網站找到,並且有更多關於 IPT 如何使用它們的說明請參考 xref.dwca-guide.adoc[此處]。要匯入達爾文核心集檔案,點選標有「選擇檔案」的按鈕來找到目標檔案。選擇檔案後,其名稱將顯示在「選擇檔案」按鈕旁。
點擊標有「創建」的按鈕。如果匯入檔案時發生問題,系統將顯示錯誤訊息通知使用者。如果匯入成功,將顯示資源概覽頁面,頁面頂部會有一則訊息說明匯入的結果。
上傳已壓縮的 IPT 資源配置資料夾
使用者可以從壓縮的 IPT 資源配置資料夾建立資源的副本,前提是該資源必須在相容的 IPT 版本下建立。這種方式將複製資源所有的詮釋資料、來源資料和資料對照,但不會複製其註冊資訊、版本歷史、DOI、版本號碼、管理者、發布狀態、建立日期、最後發布日期,也不會保留資源的簡稱。
操作步驟如下:
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找到您要複製的資源配置資料夾。資源配置資料夾儲存在 $data-directory/resources 資料夾中,並使用資源簡稱命名。舉例來說,如果資源的簡稱是「ants」,則它將位於 $data-directory/resources/ants。
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壓縮(打包)資源配置資料夾:ants/ → ants.zip
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在「選單:資源管理」頁面的「創建新資源」部分中:
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輸入新的資源簡稱。如果壓縮資源的簡稱尚未在 IPT 中存在,則可以保留其簡稱。
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點擊標有「選擇檔案」的按鈕,然後找到並選擇已壓縮的目標資源配置資料夾。
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選擇檔案後,其名稱將顯示在「選擇檔案」按鈕旁。點擊標有「創建」的按鈕。如果匯入檔案時發生問題,系統將顯示錯誤訊息通知使用者。如果匯入成功,將顯示資源概覽頁面,並將該資源的詮釋資料、來源資料和資料對照從壓縮資源中複製到新的資源中。
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上傳詮釋資料檔案
IPT 可以匯入和匯出符合「GBIF 詮釋資料設定檔」的有效資料集詮釋資料檔案。關於 GBIF EML 詮釋資料設定檔的資訊,以及如何撰寫符合 GBIF 達爾文核心標準詮釋資料設定檔的詮釋資料文件,請參考 GBIF 詮釋資料設定檔 - 使用指南。要匯入詮釋資料檔案,選擇資源類型「僅詮釋資料」,然後點擊標有「選擇檔案」的按鈕,找到並選擇目標詮釋資料檔案。選擇檔案後,其名稱將顯示在「選擇檔案」按鈕旁。
點擊標有「創建」的按鈕。如果匯入檔案時發生問題,系統將顯示錯誤訊息通知使用者。如果匯入成功,將顯示資源概覽頁面,其中詮釋資料也會顯示在畫面上。由於此為僅詮釋資料的資源,來源資料和對照的部分將保持隱藏。如果您稍後決定新增原始資料集,只需在詮釋資料的 [基本詮釋資料] 頁面中更改資源類型。
編輯現有的資源
現有資源表僅顯示當前使用者可以編輯的資源。要編輯資源,請在資源表中點擊資源名稱。該連結將打開所選資源的資源概覽頁面。請參考「選單:資源管理」部分中「資源概覽」標題下的說明,以了解如何編輯該資源的各種相關資料。
資源概覽
此頁面允許具有管理許可權的使用者編輯資源配置。資源名稱顯示在頁面頂部的選單列下方。如果資源尚未命名,則會在頁面頂部顯示資源簡稱,並充當標題。資源名稱下方是一個表格,左側顯示資源配置的各個類別,右側顯示相應的區段。表格中的資訊圖示可幫助引導管理者去使用各類別。這些類別各自的配置方式將在後續部分詳細說明。
來源資料
資源概覽頁面的此區域允許使用者從檔案、資料庫或 URL 匯入原始資料到 IPT。如果資源沒有來源資料,則被視為僅詮釋資料資源,即僅包含資料集的資訊,無任何原始資料。如果多個資料來源彼此相關,也可以將資源連結到多個資料來源。更多關於多個資料來源之間的關聯說明,請參閱達爾文核心標準文字檔指南的 實作指南部分。以下是選擇來源資料的初步步驟說明,無論是來自文字檔、資料庫來源或可用於 URL 的文字檔:
檔案作為資料來源
IPT 可以匯入未壓縮的分隔文字檔(如 CSV、Tab,或使用其他分隔符的檔案)或以 Zip 或 Gzip 壓縮的等效檔案,也支援 Excel 檔案。點擊「來源資料」的 ┇ 選單,選擇「添加」,然後在彈出視窗中從下拉框中選擇「檔案」,並點擊標有「瀏覽…」或「選擇檔案」的按鈕來尋找並選擇要匯入的檔案。檔案名稱僅能由字母數字字符(A-Z、0-9)、空格、底線、句號、括號和連字符組成。選擇檔案後,其名稱將顯示在「瀏覽…」按鈕的右側。
點擊標有「清除」的按鈕以移除所選檔案,並返回到選擇來源資料之前的狀態。或者,點擊標有「添加」的按鈕以打開來源資料檔案詳細頁面(如果存在同名檔案覆寫風險,系統將顯示對話框,詢問使用者是否確認覆寫)。
如果 IPT 檢測到在覆寫時已經對照的資料來源中的欄位數已更改,系統將警告使用者應更新其資料對照。 |
上傳大小限制
IPT 的上傳大小限制為 10GB。對於匯出/發布的達爾文核心集檔案,IPT 則無大小限制。若要將超過 10GB 的資料集載入 IPT,建議採用以下解決方案:
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此頁面顯示資源名稱以及檔案特徵摘要(可讀性、檢測到的欄數、檔案的絕對路徑、檔案大小、檢測到的行數和檔案最後載入到 IPT 的日期)。來源資料檔案詳細頁面允許使用者檢視並編輯描述所選檔案內容的參數,並使用這些設置來分析和預覽檔案。
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來源名稱 - 標頭,選定檔案的名稱,不包括副檔名。
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來源類型 - 來源的類型,此處為文字檔。
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可讀 - 此圖示表示資料是否可使用此頁面上所提供的檔案格式資訊。
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檔案 - 用於作為資料來源的檔案完整路徑。
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欄位數 - - 依照此頁面設定的參數,資料集中的欄位數。
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行列數 - 資料檔案中找到的行列數。(註:此數字有助於確認所有紀錄是否已被識別。)
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檔案大小 - 資料來源檔案的大小。
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最後修改 - 檔案最後儲存的日期戳記。
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來源紀錄 - 此連結下載處理檔案時所產生的紀錄檔案,記錄了此頁面的資訊。任何處理過程中遇到的問題,例如遺失的資料或意外格式,將會顯示在此紀錄檔案中。
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分析 - (在選項下拉選單中)按此按鈕以根據此頁面的檔案設定生成資料摘要。分析會顯示檔案是否可讀,若可讀,則顯示欄位數。
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預覽 - (在選項下拉選單中)按此按鈕以檢視檔案中的資料解釋。
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標頭列數 - 若檔案不包含欄位名稱列則為 0,若包含欄位名稱列則為 1。
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欄位分隔符 - 資料欄位之間分隔的字符或字符組合。
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欄位引號 - 用來標示資料欄位起始的單一字符(或無),例如 ' 或 "。請注意,若欄位內容包含換行符號(\n)或回車符號(\r),則無法正確地標示欄位內容的起始。
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複數值分隔符 - 用來分隔擁有多於一個值的欄位的單一字符(例如 | 或 ;)。
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字元位元系統 - 定義資料中字元的位元系統(例如 ISO 8859-5 指的是西里爾字母)。
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日期格式 - 用於描述具有日期型別的欄位格式的代碼(例如 YYYY-MM-DD 表示四位數年份、兩位數月份和兩位數日期,以短橫分隔)。
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已選工作表 - (僅適用於 Excel 檔案)此下拉選單列出 Excel 檔案/活頁簿中所有工作表的名稱。僅可使用 1 張工作表作為資料來源,默認為第一張工作表。更改工作表後,點擊 Analyse 以更新行/列資訊。
設定好資料來源的參數以確保檔案正確解讀後,點擊標示「儲存」的按鈕以儲存此設定。如果儲存成功,將顯示「資源概述」頁面,並在此頁面上顯示該檔案的摘要資訊。要重新開啟「來源資料檔案」的詳情頁,只需點擊相關項目。
若使用者想要刪除此來源,他們可以重新開啟「來源資料檔案」的詳情頁,然後按「刪除來源檔案」按鈕。需注意,任何與此檔案相關的資料對照也會被刪除。
若來源資料包含多個文字檔,則可以對每個要匯入的檔案重複執行此部分描述的過程。也可以匯入包含多個文字檔的壓縮資料夾,以一次性新增多個來源檔案。
資料庫作為資料來源
IPT 可以使用資料庫連接來從表格或檢視表中匯入資料。受支援的資料庫連接列表請參見 受支援的資料庫 一節。要設定資料庫作為資料來源,點擊 ┇ 選單並選擇「新增」。然後從彈出視窗的下拉選單中選擇「資料庫」,再點擊標示「連接」的按鈕,這將打開「來源資料庫」的詳情頁。
「來源資料資料庫」的詳情頁顯示了資源名稱及資料庫特徵摘要(可讀性、偵測到的欄位數),並允許使用者查看及編輯如何從資料庫訪問資料的參數,以及使用這些設定來分析和預覽資料。
若 IPT 偵測到資料對照的來源資料中欄位數在編輯時發生了變化,系統會提醒使用者將其更新。 |
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來源名稱 - 標頭,資料來源的名稱。與檔案資料來源不同,使用者可以編輯並任意命名此名稱。
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來源類別 - 資料來源的類別,此處為 SQL。
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可讀性 - 此圖示指示資料是否可使用此頁面上提供的連接資訊訪問。
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分析 - (在選項下拉選單中)按此按鈕以根據此頁面的資料庫連接設定生成資料摘要。分析報告會顯示資料庫是否可讀,若可讀,則顯示 SQL 語句結果中的欄位數。
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預覽 - (在選項下拉選單中)按此按鈕以根據此頁面的資料庫連接設定來檢視詮釋資料的內容。
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資料庫系統 - IPT 必須連接以檢索資料的關聯式資料庫管理系統。
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資料庫主機 - 資料庫伺服器地址,可選擇包含非預設埠號(例如 localhost 或 mysql.example.org:1336)。對於 ODBC 連接,不需要此項。
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資料庫 - 資料庫管理系統中的資料庫名稱,或 ODBC 連接的 DSN。
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資料庫使用者 - 連接資料庫時使用的資料庫使用者名稱。
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資料庫密碼 - 連接資料庫的資料庫使用者密碼。
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* SQL 語句* - 用來從資料來源資料庫中讀取資料的結構化查詢語言(SQL)語句。語句將依原樣傳送至已設定的資料庫,因此可以使用資料庫的任何原生功能,如函數、分組語句、限制語句或聯集語句(如果支援)。例如:SELECT * FROM specimen JOIN taxon ON taxon_fk = taxon.id。測試大型的來源資料時,建議在 SELECT 語句中加入相應語句以限制查詢返回的行數,例如在 MySQL 中 SELECT * FROM specimen JOIN taxon ON taxon_fk = taxon.id LIMIT 10。當語句已經過與達爾文核心資料對照的完整測試後(參見以下章節),使用者可以將 SQL 語句更改為回傳完整的資料集。
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字元位元系統 - 定義資料中字元位元的系統(例如 Latin1、UTF-8)。
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日期格式 - 用於描述具有日期型別的欄位格式的代碼(例如 YYYY-MM-DD 表示四位數年份、兩位數月份和兩位數日期,以短橫分隔)。
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複數值分隔符 - 用來分隔擁有多於一個值的欄位的單一字符(例如 | 或 ;)。
當來源資料的參數設定完成並可以正確訪問資料後,點擊標示「儲存」的按鈕以儲存此配置。若儲存成功,將顯示「資源概述」頁面,並在來源資料區塊右側顯示資料的摘要資訊。來源資料摘要資訊中還會顯示一個標示「編輯」的按鈕,允許使用者重新開啟「來源資料庫」的詳情頁。
URL 作為來源資料
IPT 可以直接從 URL 匯入未壓縮的分隔文字檔案(CSV、tab 檔或其他分隔符號檔案)或壓縮檔案。點擊 ┇ 選單並選擇「新增」。接著,從來源資料類型的下拉選單中選擇「URL」,然後提供來源的名稱和類型,或直接將完整 URL(包括 http:// 或 https://)貼入下方的框中。
點擊標示為「清除」的按鈕可移除 URL 選擇並回到選取資料來源前的狀態。或者,點擊標示為「新增」的按鈕來開啟來源資料 URL 的詳情頁。
此頁面顯示資源名稱和 URL 特徵的摘要(可讀性、檢測到的欄數、URL 位置、檢測到的行數以及 URL 最後載入 IPT 的日期)。來源資料 URL 的詳情頁允許使用者查看和編輯描述所選檔案內容的設定參數,並使用這些設定進行分析和預覽。
從這裡開始的流程與使用檔案作為資料來源的方式非常相似。詳情請參閱 檔案作為資料來源 章節。
達爾文核心標準資料對照
資源概覽頁面的此部分允許使用者將傳入資料中的欄位對照到已安裝擴展中的欄位,並查看哪些來源欄位尚未進行對照。此選項僅在至少一個資料來源成功新增,且至少一個延伸資料集已安裝後才可用。
當滿足這些條件後,該下拉列表將包含一個選擇框,列出已安裝的核心類型和延伸資料集。選擇一個核心類型並進行對照,然後選擇要對照的延伸資料集。選擇與來源資料欄位相符的延伸資料集。如果在選擇框中沒有出現所需的核心類型或延伸資料集,則需要先安裝該延伸資料集。詳情請參閱「選單:系統管理」章節中的「設定核心類型和延伸資料集」標題下的說明。
選擇所需的核心類型或延伸資料集後,點擊標示為「新增」的按鈕以開啟 資料來源選擇頁面。
資料來源選擇頁面
此頁面說明延伸資料集支援的資料類型,並顯示一個包含所有已配置的資料來源的選擇框。
一個資源只能使用一種核心類型:當資源以分類單元名稱為基礎時,選擇「達爾文核心標準清單」;當資源以自然界中的出現紀錄(觀測紀錄)或收藏品(標本)為基礎時,選擇「達爾文核心標準出現紀錄」。只有在所需的核心類型完成對照後,才可以對照其他延伸資料集。 |
使用者可以將不同於該核心類型的其他核心類型作為延伸資料集進行對照。 |
選擇要對照的資料來源,然後點擊標示為「儲存」的按鈕以開啟資料對照的詳情頁(請跳轉到下文的 [資料對照詳情頁] 以獲取實際進行對照的說明)。
新增對照後,它將顯示在「達爾文核心標準資料對照」。此區域會列出所有資源的對照,分為核心類型資料對照和延伸集資料對照。點擊任一項目以修改它,或點擊 ┇ 選單並選擇「預覽」來預覽當前的資料對照。建議資源管理者在發布新版本前預覽所有資料對照。
資料對照細節頁面
在建立資料來源與核心類型或延伸資料集的資料對照後,這個頁面將開啟並顯示從來源資料自動對照到延伸資料集欄位的欄位數量。轉換為小寫後的欄位名稱如果相符,則欄位會自動進行對照。
資料對照頁面允許使用者基於所選擇的延伸資料集指定此 IPT 資源中的資料配置方式。頁面頂部描述了來源資料被對照到的延伸資料集。來源資料的名稱是一個返回到編輯來源資料頁面的連結,延伸資料集的名稱是指向延伸資料集說明的連結。
頁面左側的側邊欄包含了跳轉到延伸資料集中相關欄位組(類別/群組)的連結,以及頁面欄位的顯示和隱藏過濾器。
側邊欄右側為資料,分為兩欄;第一欄(左側)列出延伸資料集中的欄位名稱;第二欄(右側)包含一組控制項(選擇框、文字框)以設置擴展欄位應包含的值。如果在來源資料欄位選擇框中選擇了欄位名稱,則會顯示標記為「來源範例」的文字和標示著「翻譯」的按鈕。以下是資料對照表右欄中可能出現的控制項說明:
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來源資料欄位選擇框 - 左側選擇框為空白或包含來自資料來源的欄位名稱。IPT 根據與資料來源欄位名稱匹配的延伸資料集欄位名稱進行自動對照與填充。未對照的延伸集欄位選擇框將保持空白,表示延伸集欄位尚未對照到來源資料欄位。如果選定欄位名稱,在 IPT 發布資源時生成的達爾文核心集檔案中,該資源將使用來源資料中的欄位值作為延伸集欄位的值。
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來源資料欄位選擇框 - ID 欄位 - 此欄位可以對照到來源資料欄位,也可以設置為「無 ID」,表示該欄位不會對照到來源資料欄位。ID 欄位是連接兩個來源紀錄的必要條件。對於分類單元核心類型的 “taxonID” 欄位,可利用“行號”或“UUID生成器”自動生成 ID。
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常數值文字框 - 要將已發佈的來源資料中的每一筆紀錄的非標識延伸集欄位值設為單一常數值,請在該欄位的選擇框右側的文字框中輸入所需的常數。要啟用文字框,請確保來源欄位選擇框中未選擇任何值。例子如下:
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控制常量選擇框 - 如果延伸集的右邊欄位是一個選擇框而不是文字框,代表了該欄位僅能選填控制詞彙。選擇一個詞彙列表中的值作為常量,以替代輸入文字框的方式賦值。
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使用資源 DOI -(特殊控制常量)可設置 datasetID 的預設值為資源 DOI。此選項僅適用於具有 Darwin Core 項 datasetID 的延伸資料集,例如出現紀錄延伸集。要啟用該複選框,請確保來源資料欄位未被選擇且控制常量未被輸入。
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詞彙詳細按鈕 - 若延伸資料集欄位受限於控制詞彙,則複選框旁會有一個圖標。點擊此圖標可在新標籤頁中打開 詞彙詳情頁,查看該延伸資料集欄位所接受的值及其解釋和各種語言的同義詞。
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來源範例 - 此區域顯示來源資料選定欄位的前五條紀錄的實際值,值之間用空格和字符 | 分隔,幫助使用者判斷來源資料欄位的內容是否適合對照到延伸資料集的欄位。
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轉譯 - 點擊此按鈕可打開 資料值轉譯頁,在該頁中可以將來源資料中選定欄位的不同值轉譯成在 IPT 為此資料資源生成的檔案中的新值。輸入並儲存轉譯後,會返回到資料對照頁面,並顯示一個包含轉譯數量的連結以替代「轉譯」按鈕。點擊此連結可重新打開該延伸集欄位的 資料值轉譯頁。
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過濾器 - 過濾器允許使用者篩選出任一來源資料欄位有符合指定條件的紀錄。使用過濾器時,首先從下拉選單中選擇是否希望過濾器在轉譯後或轉譯前應用(有關轉譯的更多詳情,請參閱上述關於轉譯的部分)。接著,通過左側的選擇框來選擇要依據哪個欄位設置條件。右側的文字框中可以輸入一個值,這個值將與來源資料欄位的值進行比較。請勿使用任何標點符號包圍輸入的值。第二個選擇框允許使用者選擇以下比較運算符之一:
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為空 - 如果來源資料欄位為空,則此運算符為真。在這種情況下,右側的文字框中不需要任何值。如果文字框中有值,則將被忽略。
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不為空 - 如果來源資料欄位不為空,則此運算符為真。在這種情況下,右側的文字框中不需要任何值。如果文字框中有值,則將被忽略。
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等於 - 如果來源資料欄位等於右側文字框中的值,則此運算符為真。相等性是基於字串匹配來評估的,因此,如果資料來源的記錄值為 2.0,而文字框中的值為 2,該記錄將不會包含在過濾後的資料集中。
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不等於 - 如果來源資料欄位不等於右側文字框中的值,則此運算符為真。相等性是基於字串匹配來評估的,因此,如果資料來源的記錄值為 2.0,而文字框中的值為 2,該記錄將包含在過濾後的資料集中。
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必填欄位 - 如果該核心類型或延伸資料集有任何必須對照的屬性,這些屬性名稱會被突出顯示。請注意,如果核心類型為出現紀錄,basisOfRecord 必須進行對照。未對照 basisOfRecord 欄位,則資料發布將會失敗。另外,對於 ID 欄位,僅在需要將兩個來源連接在一起時才需要此欄位。
除了頁面頂部有關延伸資料集的說明資訊和上述兩個欄位外,資料對照頁面可能還包含以下部分、連結和按鈕:
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資源標題 - 點擊此連結將跳轉到資源概覽頁面,並且不會儲存任何待處理的變更。
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隱藏未對照欄位 - 此過濾器/連結將隱藏頁面上所有尚未對照的欄位,只顯示已完成對照的欄位。如果要再次查看尚未對照的欄位,請點擊「顯示所有」連結。
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顯示所有欄位 - 此過濾器/連結將使所有欄位可見,無論是否已對照。此連結僅在已啟用「隱藏未對照欄位」後顯示。
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隱藏重複類別 - 此過濾器/連結將隱藏頁面上所有屬於重複的類別/術語群組欄位。如果某個類別已經包含在核心延伸資料集中,那麼該類別就是重複的。如果要再次查看屬於重複類別的欄位,請點擊「顯示所有類別」連結。此連結僅在已啟用「顯示所有類別」後顯示。
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顯示所有類別 - 此過濾器/連結將使所有屬於重複類別/群組的欄位可見。此連結僅在已啟用「隱藏重複類別」後顯示。
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儲存 - 點擊任何標有「儲存」的按鈕將保存頁面上的變更。
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刪除 - 點擊此按鈕將刪除對資料來源的所有對照,而不僅僅是刪除已對照的欄位,並返回資源概覽頁面。
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返回 - 點擊此按鈕將撤銷自上次儲存以來在此頁面上所做的所有變更,並返回資源概覽頁面。
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未對照欄位 - 此區域包含來源檔案、表格或視圖中尚未對照的欄位列表。此列表有助於判斷是否已將所有應該對照的資料來源欄位進行對照。
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重複術語類別 - 此區域包含重複術語類別的列表,即這些術語類別已經出現在核心延伸資料集中。理想情況下,已在核心延伸資料集中對照的術語不需要在延伸資料集中再次對照。隱藏重複術語還能進一步提高使用者在對照頁面的使用體驗。
資料值轉譯頁
當此頁面首次開啟時,頁面頂部會顯示一條訊息,指出來源資料中所選欄位獨特的值的數量,最多顯示 1000 個值。頁面會顯示正在進行轉譯的延伸資料集欄位的名稱和說明。如果該欄位受限於控制詞彙,則該詞彙的相關資訊和一個開啟詞彙詳情頁面的圖示(請參閱上述詞彙詳情按鈕的說明)將出現在欄位說明的下方。在欄位說明下方,會顯示一個表格,其中「來源資料值」列顯示來源資料中發現的欄位獨特的值,「轉譯資料值」列下方則有文字框。請在文字框中輸入需被轉譯的來源資料值。轉譯資料值文字框左側的圖示會顯示所提供的值是否存在於該詞彙中。
表格的上下分別有以下幾個按鈕:
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儲存 - 點擊此按鈕以儲存此頁面上所做的所有變更,並返回資料對照頁面。
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刪除 - (從選項下拉選單)點擊此按鈕以移除該欄位的所有轉譯內容,並返回資料對照頁面。
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重新載入 - (從選項下拉選單)點擊此按鈕以再次搜尋來源資料中的獨特值。現有的轉譯會被保留,而來源資料中的任何未轉譯的新獨特值將出現在列表中。
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自動對照 - (從選項下拉選單)此按鈕僅在該欄位受限於控制詞彙時顯示。點擊此按鈕可基於已知的同義詞自動填入標準的轉譯資料值。對於來源資料中沒有已知同義詞的值,將保持空白。
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取消 - 點擊此按鈕以關閉轉譯值頁面,且不儲存所做的任何變更。
詮釋資料
資源概覽頁面的這個區域允許使用者編輯資源的詮釋資料。請點擊 ┇ 選單,然後從下拉選單中選擇「編輯」以進行編輯。每個資源都需要一組最低限度的描述性詮釋資料,以便能夠在 GBIF 網路上發布,並在需要時由 GBIF 分配 DOI。如果有任何必填的詮釋資料缺失,資源概覽頁面將在詮釋資料區域顯示「不完整」的徽章。
使用者可以上傳一個現有的資源檔案來取代任何現有的詮釋資料。點擊 ┇ 選單,然後選擇「上傳」。接著點擊「瀏覽」按鈕並選擇 EML 檔案。
點擊「編輯」選項會開啟 [基本詮釋資料] 頁面,這是一系列詮釋資料頁面中的第一頁。當完成任何詮釋資料頁面的資料輸入並點擊「儲存」按鈕後,下一頁將依序顯示。當最後一頁的詮釋資料儲存後,將返回 [基本詮釋資料] 頁面。在任何頁面點擊「取消」按鈕將放棄該頁面上所做的任何變更並返回資源概覽頁面。在每個詮釋資料頁面的左側欄中,有一個指向所有詮釋資料頁面的連結列表,便於參考和跳轉。點擊任一連結即可開啟對應的詮釋資料頁面。
以下是詮釋資料頁面及其內容的清單:
Basic Metadata
所有詮釋資料欄位均為必填。請注意,每個聯絡人的資訊至少需提供姓氏、職位或所屬組織。
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標題 - 資源的標題。此標題將作為資源的名稱顯示在 IPT 中,也會出現在 GBIF 註冊庫中,並構成引用的一部分。請使用對資料集使用者描述性強的標題,例如「丹麥自然歷史博物館(SNM)的坦尚尼亞鳥類收藏」,而非「aves_tz_snm」。避免使用僅為您的組織所知的檔名或縮寫。
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發布組織 - 負責發布(生成、發布或保存)該資源的組織。此組織在將資源註冊到 GBIF 或在分配 DOI 時將被作為資源的權利持有人和發布組織。該組織還將用於自動生成資源的引用(如果開啟了自動生成功能)。如果所需的組織未出現在清單中,可以由 IPT 管理員新增(請參閱「選單:系統管理」部分中的「組織配置」標題下的資訊)。請注意,資源在註冊到 GBIF 或分配 DOI 後,您的選擇將無法更改。
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更新頻率 - 資源初次發布後進行更改的頻率。為方便起見,該值將預設為自動發布間隔(如果已開啟自動發布功能),但之後可以隨時將其覆寫。請注意,資源的維護頻率說明也可以在其他詮釋資料頁面中輸入。
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類型 - 資源的類型。此欄位的值取決於資源的核心對照,並且如果已經完成 Darwin Core 對照,該值將無法再編輯。如果在清單中找不到所需的類型,可以選擇「其他」。請查看「選單:系統管理」部分的「核心類型和延伸資料集配置」標題下的資訊。
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子類型 - 資源的子類型。此欄位的選項取決於類型欄位。如果清單中未找到所需的子類型,可保持預設選項。
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詮釋資料語言 - 詮釋資料所使用的語言。
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資源語言 - 資源資料所使用的語言。
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資料授權 - 資源所適用的授權。授權提供了一種標準化方式來定義您的作品適用的使用方式。GBIF 鼓勵發布者從三種(預設)機器可讀選項(CC0 1.0、CC-BY 4.0 或 CC-BY-NC 4.0)中選擇限制最少的授權,以鼓勵資料能被更廣泛地使用和應用。了解更多關於 GBIF 授權政策,請參閱 此處。如果您無法選擇其中任何一種授權,請聯絡 GBIF 秘書處 participation@gbif.org。如需了解如何在紀錄層級上給予授權,請參閱 如何為資料集授權。如需了解如何更改 IPT 的預設授權選項,請參閱 IPT 維基中的 資料集授權頁面。
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說明 - 一段簡短的資源概覽,分段說明。應提供足夠的信息,幫助潛在使用者瞭解該資料是否可能引起他們的興趣。
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資源聯絡人 - 資源聯絡人和組織的清單。他們應被聯絡以獲取更多關於該資源的資訊,包括如何維護資源,處理資源及其資料的潛在問題。清單中的聯絡人可以通過拖放操作進行重新排列。
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從其他資源複製 - 點擊此連結可從任何資源中複製聯絡資料。彈出視窗會顯示選擇資源和聯絡人的選項。
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新增資源聯絡人 - 點擊此連結可開啟新增聯絡人表單。
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移除此資源聯絡人 - 點擊此連結以移除該資源聯絡人,該聯絡人位於連結下方。
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名字 - 資源聯絡人的名字。
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姓氏(當職位和組織為空時必填,當名字非空時必填)- 資源聯絡人的姓氏。
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職位(當姓氏和組織為空時必填)- 資源聯絡人所擔任的相關職位或頭銜。
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組織(當姓氏和職位為空時必填)- 與資源聯絡人相關的組織或機構。雖然該組織可能是GBIF註冊的組織之一,但這不是必要的。因此,需在文字框中輸入組織名稱,而非從已註冊組織列表中選取。
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地址 - 資源聯絡人的實體街道或建築地址。
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城市 - 資源聯絡人地址中的城市、城鎮、縣市或類似的實體地點。
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州/省 - 資源聯絡人地址中的州、省或類似的地理區域。
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國家 - 資源聯絡人地址中的國家或其他第一級行政區域名稱。
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郵政編碼 - 資源聯絡人地址的郵政編碼(例如,郵遞區號)。
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電話 - 聯絡資源聯絡人的首選完整國際電話號碼。
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電子郵件 - 聯絡資源聯絡人的首選電子郵件地址。
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主頁 - 資源聯絡人的網頁URL。
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人員目錄 - 該人員標識符所屬的人員目錄系統的URL。默認提供四種名錄可選:ORCID、ResearchID、LinkedIn和Google Scholar。如果需要更改 IPT 的默認目錄設置,請參閱 IPT 維基中的新增使用者ID目錄頁面。
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人員標識符 - 16位的ORCID ID(例如0000-0002-1825-0097)或將此人連結到指定人員目錄的其他標識符。
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資源創建者 - 創建資源的個人和組織,按優先順序排列。該列表將用於自動生成資源引用(若開啟自動生成功能)。如果此個人或組織與第一個資源聯絡人相同,所有聯絡人的詳細資訊可以透過點擊「從資源聯絡人複製詳細資訊」的連結自動填充至資源創建者的對應欄位。資源創建者所需資訊與資源聯絡人具有相同的欄位和要求。請參閱上文中的資源聯絡人欄位解釋。
在IPT中的資源創建者以及有效發布該資源的負責人或組織可以將自己添加為相關團隊中的「發布者」角色。 -
詮釋資料提供者 - 負責產生資源詮釋資料的個人或組織。如果此個人或組織與第一個資源聯絡人相同,所有聯絡人的詳細信息可以透過點擊「從資源聯絡人複製詳細信息」的連結自動填充至詮釋資料提供者的對應欄位。詮釋資料提供者具有與資源聯絡人相同的欄位和要求,請參閱上文中的資源聯絡人欄位解釋。
地理涵蓋範圍
此詮釋資料頁面包含有關資源涵蓋的地理區域的資訊。頁面上有一個地圖及相關控制項,允許使用者設定地理覆蓋範圍。下方為地理覆蓋頁面的內容螢幕截圖,以及控制項的相關說明。
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從來源資料自動推斷 - 來源資料將被分析並在發布時自動設定地理覆蓋範圍。
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預覽推斷結果 - 分析來源資料並顯示推斷的值。
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覆蓋範圍地圖 - 若已連接到網際網路,地理覆蓋頁面將顯示一張地圖。此地圖上顯示一個具有控制點(標記)的框。標記位於框的所有角落,對應緯度和經度文字框中的值。拖動整個框,或拖動個別標記至新位置即可重新設定框的地理邊界。對應的緯度和經度值將同步變更以匹配地圖上的框。地圖具有地形陰影、自然植被顏色、進階標籤等功能,並提供放大(+)和縮小(-)按鈕,可向任意方向拖動以變更顯示的地球上的區域。
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設定全球覆蓋範圍? - 點擊此複選框以將地理覆蓋範圍更改為覆蓋整個地球。
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南/西 & 北/東 - 這四個文字框對應於資源覆蓋區域邊界框的SW和NE角。需輸入的值為小數度數(例如45.2345),標準限制值為-90至+90緯度(南/北)以及-180至+180經度(西/東),北半球為正緯度,格林威治子午線以東至國際日期變更線為正經度。拖動地圖上的邊界框標記將自動設定這些值,但亦可直接在文字框中手動輸入有效值。儲存頁面以更新地圖。
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描述 - 地理覆蓋範圍的文字描述。該資訊可作為其他欄位資訊的替代或補充。
Taxonomic Coverage
此詮釋資料頁面允許使用者輸入有關資源所涵蓋的一個或多個分類群群組的資訊,每個群組被稱為分類群範圍。每個範圍包括一個說明和分類群列表,其中每個分類群包含分類群名稱(科學名或通用名)和分類位階。在尚未建立任何分類群範圍之前,頁面上僅顯示一個標記為「新增分類群範圍」的連結。點擊該連結將新增一個要求提供說明的文字框和幾個同樣的操作連結。以下為在尚未輸入任何資料時,分類群範圍頁面內容的螢幕截圖以及該狀態下控制項的相關解說:
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自動從來源資料推斷 - 來源資料將被分析並在發佈時自動設定分類群範圍。
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預覽推斷結果 - 分析來源資料並顯示推斷的值。
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移除此分類群範圍 - 點擊此連結可移除該連結正下方的分類群範圍,包括相關說明、列表及所有單一分類群條目。
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說明 - 對資源中代表的分類群範圍的文字說明。每個分類群範圍都有自己的說明。此資訊可用於替代或補充頁面中其他欄位的資訊。
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新增多個分類群 - 此連結在頁面上新增一個標記為「分類群列表」的文字框。
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分類群列表 - 此文字框允許使用者輸入一個分類群列表。每行輸入一個分類群,使用ENTER鍵進行分行。輸入的分類群被視為學名。
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新增 - 此按鈕將輸入到「分類群列表」文字框的值在分類群範圍內建立相應的科學名。
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新增單一分類群 - 此連結新增控制項以輸入分類群範圍中的單一分類群——包括學名和俗名的文字框、一個標示位階的選擇框,以及一個「移除此分類群」的連結。分類群可以為學名和俗名的任意組合,並可選擇輸入位階。
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學名 - 此文字框用於輸入分類群的學名。
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俗名 - 此文字框用於輸入分類群的俗名。
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位階 - 此文字框用於輸入分類群的分類位階。
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移除此分類群 - 點擊此連結將移除分類群(學名、俗名和位階)。
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新增分類群範圍 - 點擊此連結以新增一個新的分類群範圍表單,其中包括標記為「說明」的文字框及如上所示的「新增多個分類群」和「新增單一分類群」的連結。
Temporal Coverage
這個詮釋資料頁面包含有關資源所涵蓋的一個或多個日期、日期範圍或命名的時間段的資訊,每個時間段被稱為時間範圍。範圍可能涉及資料集或集合被創建的時間(單一天、日期範圍或形成時期),或者資料集或集合中主體存在的時間(生存時間段)。在建立資源的首個時間範圍之前,頁面僅顯示一個標記為「新增時間範圍」的連結。點擊該連結會顯示默認的時間範圍類型「單一天」選擇框、一個標記為「開始日期」的文字框、一個日曆圖示,以及兩個相關連結。以下為尚未輸入資料時的默認時間範圍頁面螢幕截圖以及該狀態下控制項的解釋:
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自動從來源資料推斷 - 來源資料將被分析並在發布時自動設定時間範圍。
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預覽推斷結果 - 分析來源資料並顯示推斷的值。
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新增時間範圍 - 點擊此連結以新增一個新的時間範圍表單。
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移除此時間範圍 - 點擊此連結以移除該連結正下方的時間範圍。
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時間範圍類型 - 從選擇框中選擇其中一個選項以設置時間範圍類型,類型可以是單一天、日期範圍、形成時期或生存時間段。選擇某種類型後,將顯示與該選項相關的控制項,詳見下文說明。
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單一天 - 此為新增時間範圍時顯示的默認類型,用於表示一天的覆蓋範圍。選擇此類型後,會顯示一個標記為「開始日期」的文字框及在其右側的日曆圖示,通過此圖示可選擇日期。
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開始日期 - 此文字框用於輸入單一天範圍的日期,格式需符合指定日期格式。可以點擊日曆圖標選擇日期,也可以手動輸入。欲知指定的日期格式,請點擊旁邊的資訊圖標。例如:2010-12-31 對應公曆的2010年12月31日。
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日期範圍 - 此時間範圍類型用於描述集合中對象被收集的起止日期。選擇此類型後,會顯示兩個文字框,分別標記為「開始日期」和「結束日期」,各在其右邊附有一個用來點選日期的日曆圖標。
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開始日期 - 用於輸入日期範圍的開始日期的文字框,格式需符合支持的日期格式。可以點擊日曆圖標選擇日期,也可以手動輸入。欲知指定的日期格式,請點擊旁邊的資訊圖標。例如:2010-12-31 對應公曆的2010年12月31日。
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結束日期 - 用於輸入範圍結束日期的文字框,格式需符合支持的日期格式。可以點擊日曆圖標選擇日期,也可以手動輸入。欲知支持的日期格式,請點擊旁邊的資訊圖標。例如:2010-12-31 對應公曆的2010年12月31日。
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形成時期 - 此時間範圍類型適用於標示資料集或集合在特定時間段內被組建。例如:「維多利亞時期」、「1922-1932」或「約1750(c. 1750)」。
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生存時間段 - 此時間範圍類型適用於標示資料集中生物體存在的時期,包括地質年代。例如:「1900-1950」、「明朝」或「更新世」。
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關鍵字
此詮釋資料頁面允許使用者為資源創建一個或多個關鍵字集。每個關鍵字集都可以關聯一個管理其術語的同義字庫或詞彙表。
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移除此關鍵字集 - 點擊此連結移除該連結正下方的關鍵字集。
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詞庫/詞彙表 - 輸入關鍵字集中所用詞庫或控制詞彙的名稱。如果關鍵字集未被詞庫/詞彙表管理,輸入「n/a」以標示不適用。例如:IRIS關鍵字詞庫。
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關鍵字列表 - 輸入一個描述或與資源相關的關鍵字列表,並用逗號分隔。
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新增關鍵字集 - 點擊此連結以新增關鍵字集表單。
相關團體
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從其他地方複製 - 如果此人或組織與任何資源的其他聯絡人相同,點擊此連結可將其詳細資訊複製到該關聯方的相應欄位。
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移除此關聯方 - 點擊此連結移除該連結正下方的關聯方。
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角色 - 此選擇框包含一個 角色列表,用於標示關聯方在資源中的角色。點擊選擇框左側的資訊圖標可查看角色相關說明。選擇列表中最適合的角色。
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作者 - 指與資料集相關的出版物或資料論文的作者。
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內容提供者 - 對資料集貢獻內容的代理人(描述的資料集可能是由多個部分組成的)。
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資料管理人 - 負責資料集的或對資料集進行管理和維護的代理人。
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發行者 - 參與資料集發布/分發流程的代理人。
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編輯者 - 與使用該資料集的出版物相關的,或是發布該資料論文的代理人。
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詮釋資料提供者 - 負責提供詮釋資料的代理人(與基本詮釋資料頁面中的詮釋資料提供者相同)。
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初始作者 - 最初收集或準備資料集的代理人(與基本詮釋資料頁面中的創建者相同)。
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擁有者 - 擁有資料集的代理人(可能與資料管理人相同或不同)。
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聯絡人 - 可用於進一步獲取資料集相關資訊的聯絡代理人。
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主要研究人員 - 與資料集相關的主要學術聯絡人。
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資料處理者 - 負責對資料集進行收集後處理的代理人。
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出版者 - 與使用資料集的發布物或資料論文的發布相關的代理人。
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使用者 - 使用資料集的代理人。
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程式開發人員 - 提供與資料集相關的資訊學或程式設計支援的代理人。
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策展人 - 負責維護和記錄蒐藏資料集合中標本的代理人。他們的職責包括準備和標記標本,以便於識別,並保護這些標本。
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審查者 - 負責審查資料集並驗證其資料和/或詮釋資料質量的人員。此角色類似於學術發布流程中的同儕審查員角色。
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新增關聯方 - 點擊此連結以新增一個額外的關聯方表單。
計劃資料
此詮釋資料頁面包含有關資源中資料生成的專案資訊。
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標題 - 專案的標題。
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識別碼 - 研究專案的唯一識別碼。這可用於連結與相同專案相關的多個資料集/EML文件實例,例如監測系列的實例。這些連結的性質可在專案說明中加以描述。
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說明 - 有關研究專案的摘要。
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資助 - 有關專案資助及其來源的資訊(如資助標題與編號、合同編號、名稱與地址、活躍時期等)。也可包括其他與資助相關的資訊。
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研究區域描述 - 專案發生的物理區域描述(如地理位置、棲息地、時間範圍等)。
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設計說明 - 專案設計與目標的相關敘述。可包括目標、動機、理論、假設、策略、統計設計和實際工作等詳細說明。
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專案人員 - 參與專案的人員列表。
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人員名字 - 與專案相關的人的名字。
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人員姓氏 - 與專案相關的人的姓氏。
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人員目錄 - 該人員標識符所屬的人員目錄系統的URL。默認提供四種名錄可選:ORCID、ResearchID、LinkedIn和Google Scholar。如果需要更改 IPT 的默認目錄設置,請參閱 IPT 維基中的新增使用者ID目錄頁面。
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人員標識符 - 16位的ORCID ID(例如0000-0002-1825-0097)或將此人連結到指定人員目錄的其他標識符。
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人員角色 - 與專案相關的人的角色。點擊選擇框左側的資訊圖標以查看不同角色的相關描述,並在選擇框中選擇最適合的角色。
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取樣方法
此詮釋資料頁面包含資源的資料採樣方法相關資訊。
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研究範圍 - 描述採樣發生的物理和時間條件。地理研究範圍通常是專案詮釋資料頁面“研究區域描述”欄位中一個較大範圍的代表。
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採樣說明 - 研究專案中採用的採樣步驟的文本描述。此元素的內容類似於期刊文獻方法章節中的採樣步驟描述。
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質量控制 - 此欄位描述為了控制或評估採樣步驟所產生資料的質量而採取的行動。
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步驟說明 - 研究方法中的步驟是一系列重複元素中的一種。這些元素記錄了研究中使用的一系列方法和程序,以及產生資料檔案的處理步驟。包括方法步驟的文本描述、相關文獻、軟體、儀器、來源資料以及所採取的任何質量控制措施。每個方法應該詳細描述,讓其他研究人員可以理解並在需要時再次用相同方法進行該研究。
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新增方法步驟 - 點擊此連結以在頁面上新增一個標記為「步驟說明」的文字框(如上所述)。可以新增任意數量的方法步驟。
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移除此方法步驟 - 點擊此連結以移除該連結正下方的方法步驟文字框。
引用文獻
此詮釋資料頁面包含有關如何引用此資源的資訊,以及與此資料集相關的引用書目,例如在資料生成過程中有使用或由此產生的相關發布內容。每個引用(無論是資源引用還是書目中的引用)都包含一個有助於在數位資源中找到該引用的唯一引用識別碼(可選),以及一個傳統的文字引用。在輸入任何引用資料之前,此頁面將顯示一個資源的引用識別碼文字框、一個資源引用的文字框、一個標記為「書目引用」的標題,以及一個標記為「新增書目引用」的連結。
在 GBIF.org 的資料集頁面上,自由文本引用會被覆蓋 - 更多資訊請參考 GBIF 常見問題。 |
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資源引用 - 用於引用資料集的單一引用。
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機構創建者的引用範例:
Biodiversity Institute of Ontario (2011) Migratory birds of Ontario. Version 1.2. University of Guelph. Dataset/Species occurrences. https://doi.org/10.5886/qzxxd2pa
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9 位創建者的引用範例:
Brouillet L, Desmet P, Coursol F, Meades SJ, Favreau M, Anions M, Belisle P, Gendreau C, Shorthouse D (2010) Database of vascular plants of Canada. Version 1.2. Universite de Montreal Biodiversity Centre. Dataset/Species checklist. https://doi.org/10.5886/1bft7W5f
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自動生成 - 開啟/關閉 - 開啟此功能讓 IPT 自動生成資源引用。自動生成的引用格式是基於 DataCite 的推薦格式,它符合《資料引用原則聯合聲明》。此格式包含一個版本號,對於不斷更新的資料集尤為重要。更多資訊請參閱 IPT wiki 中的 資料集引用格式 頁面。
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引用識別碼 - 用於解析至線上資料集的 DOI、URI 或其他永久識別碼。建議在引用中包含識別碼。如果資源已分配 DOI(IPT 使用方式),IPT 會將 DOI 設為引用識別碼,並且無法再進行更改。
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書目引用 - 與此資源相關的或在此資源創建過程中使用的其他資源的引用。
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新增書目引用 - 點擊此連結以新增書目中額外引用所需的文字框。
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書目引用 - 與此資源相關或在此資源創建過程中使用的外部資源引用。
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書目引用識別碼 - 用於解析至外部線上資源的 DOI、URI 或其他永久識別碼。通常應在引用的最後包含此識別碼。
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移除此書目引用 - 點擊此連結以移除該連結正下方的引用。
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採集、蒐藏資料
此詮釋資料頁面包含與資源相關的自然歷史實體蒐藏的資訊(如果有),以及這些集合中稱為策展單元的物件類型列表和其摘要資訊。在輸入任何蒐藏資料之前,頁面將顯示每個區段的標題(蒐藏集合、標本保存方法、策展單元)以及一個標記為「新增策展單元」的連結。
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蒐藏集合 - 此資源所基於的蒐藏集合列表。
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新增蒐藏資料集合 - 點擊此連結以顯示一個文字框來新增額外的蒐集資料集合於蒐藏資料章節。
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蒐藏資料集合名稱 - 蒐藏資料集合在本地語言中被認知或引用的完整標準名稱。
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蒐藏資料集合識別碼 - 蒐藏資料集合的 URI(LSID 或 URL)。在 RDF 中用作蒐藏資料集合資源的 URI。
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父蒐藏集合識別碼 - 用於標識此子蒐藏集合的父蒐藏集合。支持構建蒐藏集合和子蒐藏集合的層次結構。如果此蒐藏集合沒有父蒐藏集合,請輸入「不適用」。
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移除此蒐藏資料集合 - 點擊此連結以移除該連結正下方的蒐藏資料集合。
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標本保存方法 - 此資源涉及的標本保存方法列表,說明防止非活體蒐藏集合物理劣化所使用的處理或技術。可選的值基於 GBIF 標本保存方法詞彙表。您可以在達爾文核心標準資料對照準備工作中記錄標本的一系列準備和保存方法(http://rs.tdwg.org/dwc/terms/preparations)。請勿為活體蒐藏集合選擇任何處理方法。此部分可能與集合的策展單元相關。
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新增保存方法 - 點擊此連結以顯示一個文字框來新增保存方法。
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移除此保存方法 - 點擊此連結以移除該連結正下方的保存方法。
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策展單元 - 此資源涵蓋的策展單元數量。數量可以以範圍或具有不確定性的數值輸入。例如,策展單元包括皮膚、策展表、針、盒子和罐子等。整體上,此部分按照蒐藏資料集合的物理內容類型進行一個總結。
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新增策展單元 - 點擊此連結以顯示一個文字框來新增策展單元。當新增策展單元時,默認的「方法類型」選擇為「數量範圍」。
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方法類型 - 此選擇框允許使用者為特定類型物件選擇指定其數量的方法。此數量可以為一個範圍或具有不確定性的數量。選擇後,適當的文字框將出現以呈現該計數方法。
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數量範圍 - 此方法允許使用者設置某類單元物件數量的上下限。詳情請看上面的截圖。
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介於 - 在此文字框中輸入物件數量的下限。
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和 - 在此文字框中輸入物件數量的上限。
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具有不確定性的數量 - 此方法允許使用者設置某類物件的數量及其上下不確定性範圍。
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數量 - 在此文字框中輸入物件的平均可能數量。
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+/- - 對於該特定單位類型物件的可能計數範圍,在此文字框中輸入多於或少於其計數文字框中的數值來代表其可能的上下數量範圍。
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單元類型 - 方法類型和數量所對應的單一物件類型(標本、批次、托盤、盒子、罐子等)。
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移除此策展單元 - 點擊此連結以移除該連結正下方的策展單元。
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外部連結
此詮釋資料頁面包含連結至資源首頁以及資源其他形式(例如資料庫檔案、試算表、連結資料等)的連結與相關資訊。在輸入任何外部連結之前,該頁面會顯示一個資源首頁的文字框以及一個標示為「新增外部連結」的連結。
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資源首頁 - 輸入包含資源或其資料集相關資訊網頁的完整當前網址。
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其他資料格式 - 資源資料的其他格式連結(例如,資料庫轉存、試算表、Nexus、連結資料等)。
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新增外部連結 - 點擊此連結以顯示一個文字框來新增額外的外部連結。
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名稱 - 檔案或資料集的名稱。
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字元集 - 字元編碼的名稱或代碼(例如,ASCII、UTF-8)。
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下載 URL - 可下載該指定格式文件或資料集檔案的 URL。
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資料格式 - 文件或檔案格式的名稱或代碼(例如,CSV、TXT、XLS、Microsoft Excel、MySQL)。
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資料格式版本 - 在資料格式文字框中指定的文件或檔案格式版本(例如,2003、5.2)。
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移除此外部連結 - 點擊此標籤的連結以移除該連結正下方的外部連結。
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Additional Metadata
此詮釋資料頁面包含此資源未在其他詮釋資料頁面中記錄的其餘資訊,包括資源的替代識別碼。在輸入任何替代識別碼之前,該頁面會顯示目的、維護方法說明、額外詮釋資料文字框,替代識別碼區域的標題,以及一個標示為「新增替代識別碼」的連結。
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建立日期 - 資源首版發布的日期。此值將用於自動生成資源引用時所顯示的發布年份。該值在發布時被自動設定且不可編輯。
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發布日期 - 資源最後一次發布的日期。此值在發布時自動設定(請參閱 [資源發布] 章節)。
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資源標誌 URL - 資源的代表性標誌。可使用標誌 URL 上傳資源,或者從磁碟中選擇影像檔案進行上傳。
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目的 - 資料集開發的目的摘要。包括創建資料集的目標以及資料集的用途。
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維護說明 - 描述該資源維護的頻率。此部分補充說明基本詮釋資料頁面中所選擇的更新頻率。
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其他資訊 - 未被其他資源詮釋資料欄位記錄的任何資訊,例如專案歷史、使用當前資料發布的內容、其他地方發布的相關資料資訊等。
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替代識別碼 - 此部分包含該資源的額外或替代識別碼列表。當資源被發布時,IPT 的資源 URL 會被新增到識別碼列表中。如果資源被分配了一個新的 DOI(參見 使用 IPT),IPT 將確保此 DOI 被放置在識別碼列表的首位。當資源在 GBIF 上被註冊時,GBIF註冊表的唯一資源鍵也會新增至識別碼列表。如果該資源代表了一個現有的 GBIF 註冊資源,則可將現有的已註冊資源之 UUID 新增至識別碼列表。這將幫助 IPT 資源在註冊過程中更新現有資源,而非註冊一個全新的資源。有關如何遷移資源的更多資訊,請參閱 遷移資源 章節。
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新增替代識別碼 - 點擊此連結以顯示一個文字框來新增資源的替代識別碼。
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替代識別碼 - 該資源的替代識別碼文字(例如 URL、UUID 或其他唯一鍵值)。
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移除此替代識別碼 - 點擊此連結以移除該連結正下方的替代識別碼。
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發布資源
使用者可以利用資源概覽頁面中的這個部分發布資源的新版本。
點擊 ┇ 選單並選擇「發布」選項以觸發新版本的發布。當以下條件滿足時,「發布」選項將啟用:
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資源的必要詮釋資料已完成;
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使用者具有「管理者(具有/不具有註冊權限)」角色。
只有具有「註冊權限管理者」角色的使用者可以發布已註冊的資源,因為資源的註冊會在每次發布過程中被更新(請參閱「選單:系統管理」章節中「管理使用者帳戶」部分的「創建新使用者」章節下的角色解釋)。按下「發布」選項後,將顯示一個確認對話框:
資源管理者需輸入自上一次/當前版本發布以來,資源(詮釋資料或資料)所做更改的摘要。此更改摘要將作為資源版本歷史的一部分被儲存,並可由資源管理者通過資源首頁編輯。按下「發布」後會發生的完整說明,請參閱以下的「發布步驟」章節。
此處顯示一個表格,用於比較當前版本與待發布版本。資源管理者可以使用此表格管理資源版本控制、預覽待發布版本,並審核和驗證當前版本。表格中的資料包括:
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版本 - 跟踪當前/待發布版本`主版本.次版本`的版本號。通常僅與 IPT 發行的 DOI 流程 相關。
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當前 - 已發布的當前版本。
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待發布 - 下一個版本。
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授權 - 資源的授權(例如 CC0 1.0)。
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DOI - 若啟用了 IPT 發行的 DOIs,請參閱 DOI 工作流程。
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可見性 - 當前/待發布版本的可見性。為了將資源註冊到 GBIF,資源管理者需確保當前版本為公開狀態。
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發布於 - 當前版本發布的日期/待發布版本將發布的日期。
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發布日誌 - 按鈕。點擊以檢索當前版本的發布日誌。資源管理者可使用發布日誌來診斷發布失敗的原因。例如,有關內容的詳細說明請參閱以下 [發布狀態] 章節。此項不適用於待發布版本。
資源發布步驟
發布資源的操作包括以下描述的步驟。資源發布為全有或全無的操作,這意味著每個步驟都必須成功完成,才能發布新版本。如果任何步驟失敗,或取消發布操作,版本將復原至最後已發布的版本。
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當前的詮釋資料將寫入名為 eml.xml 的檔案中。同時,還會保存一個遞增版本的檔案,命名為 eml-n.xml(其中 n 為與發布版本對應的遞增版本號)。
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一份採用豐富文字格式(Rich Text Format,RTF)的資料發布文件將寫入名為 shortname.rtf 的檔案中。同樣,還會保存一個遞增版本的 RTF 檔案,命名為 shortname-n.rtf。
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根據資料對照配置的當前原始資源資料將寫入名為 dwca.zip 的達爾文核心集檔案中。系統將接著對達爾文核心集檔案中的資料檔案進行驗證(詳見下方「資料驗證」部分)。
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如果 IPT 的存檔模式已啟用(詳見 配置 IPT 設定部分),還會保存達爾文核心集檔案的遞增版本檔案,命名為 dwca-n.zip。
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如果資源已註冊,該資源的相關資訊將更新至 GBIF 註冊庫。
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如果使用者透過 IPT 分配了 DOI 給資源,則該資源的 DOI 詮釋資料將被更新並傳播至 DOI 解析器。
資料驗證
IPT 將資料檔案以制表符分隔的格式寫入 DwC-A,且不包含斷行符號(注意:原始資料中的斷行符號將被替換為空字串)。
寫入後,IPT 還會通過以下方式驗證其內容:
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如果核心記錄識別碼(例如 Occurrence 核心的核心記錄識別碼為 occurrenceID)的欄位存在於核心資料檔案中,IPT 將驗證每筆紀錄是否具有該識別碼,且該識別碼是唯一的。
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達爾文核心術語 basisOfRecord 是出現紀錄延伸資料集中必須的術語。因此,IPT 將驗證每個出現紀錄資料檔案是否具有 basisOfRecord 欄位。此外,還會驗證每筆出現紀錄是否具有有效的 basisOfRecord 值,並與 達爾文核心標準類型詞彙表 相匹配。
資源發布狀態頁面
一個標題為「資源發布狀態」的頁面將顯示各個發布步驟為成功或失敗的狀態消息。新版本的發布為全有或全無的事件,這意味著所有步驟必須成功完成,否則此版本將被撤銷。
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資源概覽 - 此連結將導向剛發布的資源的「資源管理」頁面。
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發布日誌 - 此連結將下載名為 publication.log 的檔案,其中包含發布過程的詳細輸出。為了幫助管理者識別發布過程中的問題,該檔案包括以下具體資訊:
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有多少筆紀錄無法讀取,未寫入達爾文核心集檔案(DwC-A)
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有多少筆紀錄缺少識別碼,或有重複的識別碼(如果核心紀錄識別碼欄位已進行對照)
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有多少筆紀錄的欄位數少於已對照的欄位數量
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日誌消息 - 「資源發布狀態」頁面會顯示儲存於 publication.log 中資訊的摘要。該檔案儲存在 IPT 資料目錄中對應資源的資料夾內,並可以透過上述「發布日誌」連結訪問。
自動定期發布
要啟用自動發布功能,請在「自動發布」點擊 ┇ 選單,然後選擇「編輯」。
選擇五種發布間隔之一(年度、半年、每月、每週或每日)並設定時間,然後按下「儲存」。
啟用自動發布後,發布間隔和下一次發布日期將會清楚地顯示在自動發布部分。可通過「編輯」選項更改或停用自動發布。
在失敗的情況下,發布將自動重試最多三次,以防止無限循環的發布。設定為自動發布但未成功完成的資源,其下一次發布日期將設置為過去的時間,並在公開和資源管理表格中被突出標記。
可見度
在「資源管理」頁面的「公開狀態」部分,擁有資源管理員權限的使用者可以更改資源的公開狀態。資源的公開狀態決定了誰可以查看它,以及該資源是否可以註冊到 GBIF。預設情況下,每個資源僅對創建者和在 IPT 上具有管理員角色的使用者可見。關於每種公開狀態的詳細說明,請參考以下資訊。
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私有 - 私有資源僅對創建者、在 IPT 上被授權管理該資源的使用者或具有管理員角色的使用者可見。這主要用於保護資源不被公開,直到其配置完成且正確無誤。
當資源準備好公開時,點擊 ┇ 選單並選擇標記為「更改」的選項。將彈出一個視窗,提供「立即公開」或「設置為某個日期公開」的選項。
提交表單後,頁面頂部將顯示一個表示狀態已更改為「公開」的消息。
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公開 - 公開資源對於使用該 IPT 實例的任何人都可見(在 IPT 首頁的公開資源表格中)。資源最終可以通過網際網路被任何知道其主頁 URL 的人訪問。不過,該資源只有在註冊到 GBIF 註冊庫後才能通過 GBIF 網站全域搜尋到(參見 註冊資源 部分)。
點擊在此部分的 ┇ 選單中的「更改」選項將顯示彈出窗口。
點擊標記為「是」的按鈕將完全移除資源的公開狀態,並將其恢復為私有狀態。
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已註冊 - 已註冊的資源可通過 GBIF 網站搜尋,並可在 GBIF 平台上索引及訪問其資料。請注意,註冊後可能需要最多一小時,資料才會被 GBIF 完成索引。註冊完成後,有關該資源的註冊資訊將顯示在 註冊資源 部分。
如果資源已註冊,每次點擊「發布」按鈕時,其註冊資訊也會在 GBIF 註冊庫中被更新。已註冊資源的公開狀態無法更改為私有。如果需要從 GBIF 註冊庫中移除資源,請按照「選單:資源管理」部分中「資源概覽」標題下的「刪除資源」部分所述的步驟進行。
註冊資源
如果資源尚未被註冊到 GBIF 註冊庫上,使用者將無法在 GBIF 網頁上成功全域搜尋該資源。
註冊資源的啟用條件包括:
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資源的必需詮釋資料已完成;
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資源已被發布(請參考下方資源概覽頁的 [資源發布] 章節);
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使用者擁有「具有註冊權限的管理員」角色(請參考「選單:系統管理」章節「管理使用者帳戶」部分中「建立新使用者」的角色說明)。具有管理員角色的使用者可將「具有註冊權限的管理員」角色授予其他使用者。
點擊 ┇ 選單並點選「註冊」以將資源註冊到 GBIF 註冊庫。
如果希望此資源更新現有的已註冊 DiGIR、BioCASe 或 TAPIR 資源,請參考下方 遷移資源 部分。 |
點擊此選項將開啟一個對話框,用以確認您已閱讀並理解 GBIF 資料共享協議(含連結)。勾選複選框以表示您同意這些條款。只有在勾選同意後,對話框底部才會出現一個標記為「是」的按鈕。點擊「是」以註冊該資源,或者點擊「否」以延遲決定並關閉對話框。
如果註冊成功,頁面頂部將出現一條訊息,表示狀態已更改為「已註冊」。當資源註冊成功時,註冊區域將顯示以下內容:
網路
此區域允許資源加入一個或多個 GBIF 網絡——這些網絡是基於特定主題的多個發布者的資料集集合。GBIF 最大的網絡是 海洋生物多樣性資訊系統 (OBIS)。
要將資源添加到某個網絡,點擊 ┇ 選單並選擇「添加」選項。要移除資源,點擊該網絡項目的 ┇ 選單並選擇「刪除」。
請僅在獲得網絡管理員或 GBIF 支援中心的批准後,才將您的資源添加到某個網絡。 |
資源管理者
每個資源都可以明確指定一個或多個管理員,這些管理員有權查看、更改和移除資源。創建資源的使用者自動擁有這些權限。可以從資源概覽頁面的選擇框中按名稱選擇其他管理員,然後點擊 ┇ 選單並點選「添加」來賦予其相同的權限。與資源相關的任何擁有「具有註冊權限的管理員」角色的使用者,也可以在 GBIF 註冊庫中註冊並更新該資源。所有具有管理員角色的使用者將自動擁有 IPT 實例中所有資源的完整管理權限。該區域將顯示資源創建者的姓名和電子郵件地址。如果已添加管理員,其姓名和電子郵件地址將列在創建者之下。任何已添加的管理員都可以通過點擊其相應的 ┇ 選單並點選「刪除」來移除其管理權限。
刪除資源
在資源概覽頁面上點擊標記為「刪除」的按鈕,將顯示一個確認視窗。
對於已在 GBIF 註冊的資源,將彈出一個提供兩個選項的視窗:
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從 IPT 和 GBIF.org 中刪除
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僅從 IPT 中刪除(未註冊)
無論選擇哪個選項,都會將資源從 IPT 中移除,並從文件系統中刪除相關的所有檔案。第一個選項也將會從 GBIF.org 中刪除該資源。
在刪除資源之前,您可以備份資料以便日後恢復。為此,請查看 IPT 的資料目錄內的伺服器,在資源資料夾中找到目標資源的目錄(以資源的簡短名稱命名)。將該目錄複製到 IPT 資料目錄之外的安全存儲位置。這樣保存的資源可以通過「選單:資源管理」部分「創建新資源」標題下的「整合現有資源配置資料夾」步驟,重新整合到 IPT 中或與另一個 IPT 實例整合。
遷移資源
現在有一種方式可以將現有已註冊的 DiGIR、BioCASe、TAPIR 或 DwC-A 資源遷移到 IPT。這使現有資源能夠保留其 GBIF 註冊庫的 UUID。
此方法只需要將 IPT 資源配置更新為其在 GBIF 註冊庫中對應的已註冊資源。
要將現有已註冊資源遷移到您的 IPT 資源,請遵循以下指示:
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確保 IPT 資源是公開且未註冊。
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確定擁有*現有已註冊資源*的組織已配置為可發布資料集的組織,並且已添加至 IPT。請參閱 添加組織 部分以瞭解更多資訊。
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在基本詮釋資料頁面上的下拉選單中點選擁有該資源的組織。請記得儲存基本詮釋資料頁面。
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前往*現有已註冊資源*的 GBIF 資料集頁面。根據 IPT 運行的模式(測試或生產),您需要分別訪問 https://www.gbif-uat.org/dataset 或 https://www.gbif.org/dataset。
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確保 GBIF 資料集頁面顯示*現有已註冊資源*正確配對相應的*資源所屬組織*。
如果顯示的*資源所屬組織*不同,必須先更新 GBIF 註冊庫才能繼續執行後續步驟。請發送電子郵件至 helpdesk@gbif.org 來請求更新。 -
從 GBIF 資料集頁面的 URL 複製 GBIF 註冊庫的 UUID,例如
5d637678-cb64-4863-a12b-78b4e1a56628
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將此 UUID 添加到 IPT 資源 的「其他詮釋資料」頁面上的替代識別碼列表中。請記得儲存「其他詮釋資料」頁面。
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確保 IPT 中沒有其他公開或已註冊的資源使用該 UUID 作為它們的替代識別碼。如果您正在嘗試替換 IPT 中現有的已註冊資源,則必須先刪除該資源。
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在資源概覽頁面上,點擊「註冊」按鈕。您需要確認已閱讀並理解 GBIF 資料共享協議,才能執行註冊。
您將收到確認消息,顯示 GBIF 中的現有資料集已被更新。
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如果適用,請發送電子郵件至 helpdesk@gbif.org,通知他們 DiGIR/BioCASe/TAPIR/IPT 支援該資源的技術安裝是否已棄用,以及是否可以從 GBIF 註冊庫中刪除。